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接下来的两天里，木叶根部的忍者们陷入了一种极度紧张、惶恐不安的状态，仿佛稍有风吹草动就能让他们惊得跳起来。短短几天时间内，竟然有十多名暗部忍者离奇失踪，而且现场没有留下任何有关凶手身份或行踪的蛛丝马迹。这一情况使得整个根部都笼罩在了一片阴霾之中。
在根部基地内部，志村团藏愤怒地咆哮着，他的怒火如同火山喷发一般无法遏制。他已经接连拍碎了七八张坚固的桌子，木屑四处飞溅，但这丝毫不能平息他心中的愤恨与焦虑。要知道，在宇智波灭族之夜中，根部已经遭受了惨重的损失，那些牺牲的忍者至今尚未得到有效的补充。而如今，又有十几名忍者神秘失踪，这无疑是雪上加霜。算下来，这些损失的忍者数量几乎快要达到根部在编的精英中忍和上忍总数的一半！如此巨大的人员损耗，直接导致了根部整体实力骤降，跌入了历史以来的最低谷。
与此形成鲜明对比的是，三代火影所领导的暗部由于在上次宇智波灭族夜的围捕行动中参与人数较少，因此受到的损伤相对有限。经过这段时间的休整恢复，暗部的实力已然远超根部。这种此消彼长的局面，令志村团藏倍感压力和忧虑。
然而，就在这剑拔弩张、一触即发的紧张氛围之下，宇智波川已经不需要再外出抓捕根部忍者获取情报了。
原来，事情要追溯到几天之前。那一天，宇智波川如往常一样，凭借着万花筒写轮眼所蕴含的强大瞳力，神不知鬼不觉地暗中观察着过往的每一名忍者，尤其是那些行踪诡秘、高来高去且戴着面具的暗部成员们。
突然之间，一个极其细微却又不容忽视的现象引起了宇智波川的高度警觉。当他的目光聚焦于这些暗部忍者的头部，尤其是靠近舌头的部位时，竟惊奇地发现那里存在着一团微小得几乎难以察觉，但却异常活跃的查克拉正在源源不断地流转着。
这个惊人的发现犹如一道闪电划过宇智波川的脑海，瞬间勾起了一段深埋在记忆深处的往事。刹那间，他恍然大悟，立刻联想到了那个令无数人谈之色变、闻风丧胆的禁忌忍术——舌祸根绝之印！毫无疑问，拥有这种特征的忍者必定与传说中的根部组织有着千丝万缕的联系。
这个重大的发现对于宇智波川后续的抓捕工作来说，无疑具有至关重要的意义。它不仅极大地提高了整个行动的确定性和成功率，更为关键的是，让宇智波川能够精准地锁定目标，避免盲目出击带来的不必要风险。
于是，在接下来的日子里，宇智波川悄无声息地展开了一场深入而细致的调查。他运用自已卓越的情报收集能力以及对木叶村地形环境的熟悉程度，小心翼翼地摸索着那些正处于休假状态的根部忍者们的住所分布情况。经过一番艰苦卓绝的努力，终于成功地将他们的藏身之处一一摸清。
万事俱备之后，宇智波川果断地决定率先向那些形单影只的根部忍者下手。因为相较于成群结队的对手，单独行动的敌人显然更容易对付，也更有利于获取更多有需要的情报。
第一天，阳光透过树叶的缝隙洒下斑驳光影，宇智波川如同鬼魅一般潜伏在一个根部忍者附近无人居住的院落里。他耐心地等待着，犹如一只猎豹静待猎物出现。终于，那个根部忍者离开了家门去采购生活物资。
待到确定已经走远的那一刻，宇智波川如闪电般闪入根部忍者的屋内，并迅速隐匿起来。他静静地守候着，心跳平稳而有力，仿佛整个世界都凝固在了这一刻。
不多时，门外传来一阵轻微的脚步声。宇智波川的双眼猛地睁开，闪烁着凛冽的光芒。随着门被缓缓推开，他毫不犹豫地发动了月读之术。刹那间，那名根部忍者只觉得眼前一花，便被拉入了一个诡异的空间之中。
在这个月读所创造的空间里，时间似乎变得无比漫长。宇智波川冷酷地开始对这名根部忍者进行拷问。各种残忍的手段层出不穷，但那名忍者却始终紧咬牙关，不肯透露半分关于实验室的信息。然而，宇智波川并没有丝毫气馁，他不断加大力度，持续折磨着对方。
就这样，时间一分一秒过去，空间内的时间已经过去了整整两天。最终，那名根部忍者的意志再也无法承受这无尽的痛苦与折磨，彻底崩溃了。不过遗憾的是，尽管他交代出了几个忍术以及根部总部的空间布局，但对于实验室的情况却是一无所知。
就在宇智波川准备结束这次拷问之时，突然察觉到一股异样的波动。原来，那名根部忍者身上所携带的舌祸根绝咒印竟然在此刻发作了！只见一道血光冲天而起，紧接着那名忍者的头颅瞬间爆开，脑浆四溅。面对如此血腥的场景，宇智波川却面不改色，因为这样的结果早在他的意料之中。
为了避免其他根部忍者在吐露重要情报之后也像这般死去，宇智波川特意利用月读空间内的时间加速功能来加快拷问进程。毕竟在月读空间里， 72 个小时仅仅相当于外界的一瞬间。凭借这种巧妙的策略，他成功地获取了一些关键信息。
接下来的一天时间里，宇智波川故技重施，又以同样的方式解决了另外 7 个根部上忍。这些人当中，大多数在月读的折磨下很快便屈服了，但仍有两人表现出超乎寻常的顽强意志。即便身处月读空间长达数天之久，他们依然坚守着秘密。
当这两名意志坚定的根部上忍好不容易从月读空间挣脱出来时，宇智波川却没有给他们任何喘息之机。他瞳孔圆圈快速转动，瞬间使用出左眼瞳术.审判业火。妖异的血红色的火焰从两名上忍身上快速燃烧起来，在他们惨叫还没发出之时，眨眼之间便将他们吞噬殆尽，甚至连一丝灰烬都未曾留下。
第二天准备抓捕拷问的几个根部家里有家人存在，所以在抓捕拷问最后一个根部忍者时不小心弄出来一点声响，导致其家人去找人帮忙报案，从而引起了志村团藏的警觉，但是因为第一天有7个上忍失踪的事情还没爆发，所以也没有太过兴师动众，只是派了一个简单的三人小队过来探测。当天宇智波川仅仅抓住了4人，拷问了3人。最后一个骨头太硬，甚至消灭他的时候弄出了声响，从而当天放弃继续行动。
到了第三天，强忍着内心的焦躁，加快了速度，等处理到第5个目标的时候，终于得知了部分实验室的大致范围信息。但是因为该目标人物只是外部的守卫，其并不清楚内部具体布局和情况，但是能够肯定的是，实验室内一定会有初代细胞，因为前几天他亲眼看到有人从实验室内拖出过长满树枝的类人型的植被去焚烧场地。
得到这个消息后，宇智波川立刻然后按照这份情报中关于内部守卫队长的消息，得知每天队长都会回家，并且是单身后，立刻出发前往队长的房子进行埋伏。
却万万没想到那个队长如此谨慎，每次出门都会在门把手和窗户中间缠了一根头发。当根部实验室的队长回家，到门口的时候发现头发断了，就直接后退发射信号弹。宇智波川马上明白被发现了。于是直接破门而出并且释放两个影分身，对着根部队长发起进攻，同时在队长的背后释放了黄泉比良坡。直接发动须佐第一阶段的手骨将其撞进去，两个影分身快速跟进后关闭掉黄泉比良坡的虫洞。本体快速离开，混进远处因为战斗和信号弹而变得有些混乱的街道人群中。
而在比良坡的异次元空间中，两个影分身其中一个快速甩出苦无将根部队长四肢钉在地上，另外一个开启月读进行拷问，拷问完获知实验室内有一个秘密通道直通后山火影岩后面的山体内，外面那个实验室是假的伪装的实验室，而山体内的那个才是真正的研究木遁的，根部队长也是在上次宇智波灭族夜火影岩被攻击粉碎的时候透过一下裂缝看到外面场景才知道的。根部在之后准备转移实验室，但是最近一段时间因为木叶重建计划，导致到目前为止还没开始转移。了解到这个情报后，施展月读的影分身因为查克拉不足而砰的一声消失，另外一个影分身马上上前用苦无刺死了根部队长。
